发布时间:2021-04-25 热度:
2020年10月27日,国度基因库生命大数据平台(CNGBdb)在第十五届国际基因组学大会(ICG-15)上重磅宣布一项全新成果——生命大数据可信计较平台CODEPLOT。
CODEPLOT是一个集可信计较情况和多元化在线阐明东西于一体的生命大数据阐明平台,是海内首个将数据加密、区块链、安详多方计较、基因安详容器虚拟化等最新安详计接应用于生命大数据阐明操作和相助共享的平台。其正式宣布将生命大数据的安详共享和操作转化带上了一个新台阶。
上图:国度基因库副研究员丁远彤博士现场先容CODEPLOT
CODEPLOT是一个机动、可信的计较平台,用户无需任何编程配景,也可利用该平台的计较东西举办自动化的生物信息学阐明。同时,它回收区块链和多方安详计较等前沿技能,确保用户的数据安详。
数据孤岛、数据安详、数据阐明门槛……
生命大数据研究面对新挑战
大数据时代下,生命科学的研究模式已经转化为数据驱动的科学发明模式,高效操作多组学、多条理的大数据可有效促进各规模的基本研究及科研成就转化。然而,海南省民企服务中心,以下痛点仍然有待办理:
当前,生命大数据多分手在科研事情者手中或研究单元内部,数据孤岛化问题严重,如何冲破这一排场?
数据共享有助科学成长,但是信息安详问题日益突出,如安在保障数据安详的环境下举办数据共享?
在数据驱动的科学发明模式中,数据阐明必不行少,但需要交错学科配景,非专业人员如何打破高门槛?
……
为了办理生命大数据研究中的上述新挑战,CNGBdb打造了集可信计较情况和多元化在线阐明东西于一体的生命大数据阐明平台CODEPLOT。
冲破孤岛/门槛的数据安详共享新模式
可信计较平台CODEPLOT
CNGBdb可信计较平台CODEPLOT基于区块链和安详多方计较等技能,以数据汇交模块存储的海量数据为支撑,以机动事情空间打点模式为焦点,同时提供多元化阐明东西,全面买通各科研机构之间的数据孤岛,打破数据阐明门槛,晋升数据操作率,促进重大科研项目相助共享及成就转化。
上图:生命大数据可信计较平台CODEPLOT
CODEPLOT为用户提供:
一、可信计较情况
基于多级权限节制,操作数据存储加密、传输加密和安详多方计较等技能,使得用户可以或许在不发布己方数据的前提下,完成自有数据阐明;以“虽互相不行见,但可共享利用”(即“可用不行见”)的方法,完成协同阐明。同时团结区块链技能,担保所有数据和计较进程均可回溯且不行改动,为平台用户提供可信的计较情况。
二、多元化东西集
提供常用的生物信息阐明流程,包罗单细胞聚类scanpy阐明、转录组差别阐明edgeR阐明、HMMER基因家属阐明、新冠病毒数据BLAST检索等16种阐明流程。同时,支持用户利用流程打点东西WDL搭建自界说的阐明流程。
三、本性化事情空间
回收事情空间构建计较沙箱,用户可在本身的事情空间内选择阐明东西、数据集和计较模式。回收单方计较模式时,用户可单独针对自有数据举办阐明,可能与平台现有的果真数据归并阐明;回收多方计较模式时,用户通过共享空间方法与差异地区研究者/研究团队举办协作阐明。
四、开放式数据资源
用户可以操作三种差异的数据集举办阐明:1.果真数据集,海南省民企服务中心,即平台基于CNGBdb及其他民众数据库(如NCBI、Pfam等)的数据资源建成的民众数据集,涵盖植物、动物、微生物、疾病等多个研究规模。2.私有数据集,即用户自行上传的自有数据集。3.授权数据集。相助同伴可以授权对方利用本身的私有数据集,以举办连系阐明。
岂论你是否有生信配景,纵然你与相助同伴相隔千里,CODEPLOT都可以帮你完成数据阐明并实现安详共享!点击如下链接当即体验CODEPLOT
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