小规模纳税人纳税方法主要有三种。

一、查账征收。此方法适用于会计制度相当完善的企业，一般税务局会根据企业出示的账目明细，了解到企业的生产经营情况之后，按照公司行业规定的税率，收取税金。

二、按时核定征税。此方法适用于没有详细考评根据或会计制度不完善的中小型纳税公司。税务局会根据实地调查结果，明确企业的销售额。并根据调查的销售额和收入计算交税额度。

三、查定征缴：此方法适用于会计制度不完善，但原料或进货单的交税企业。税务局会对其生产产品的原料、生产产品的税额、销售总额等为据，计算纳税额度。

以上便是小规模纳税人常用的三种纳税方法。大家在帮企业做税收筹划时，要根据企业实际情况选用不用的纳税方法。